乳腺癌TEC方案新辅助化疗细胞凋亡机制的研究

【摘要】目的：探讨乳腺癌TEC方案新辅助化疗细胞凋亡机制。实验方法：2008—2011年在吉林大学第二医院普通外科收治的乳腺癌新辅助患者2例，粗针穿刺明确患者浸润性乳腺癌临床诊断，并收取化疗前标本。经过4个周期TEC新辅助治疗后，采取手术治疗，获得患者化疗后组织标本，分别标记为A1，A2，B1，B2。将标本组织匀浆制取RNA，总RNA纯化并行质检。制备cRNA探针，将荧光探针纯化后，将cRNA片段化制作芯片，对基因芯片进行数据分析。并实时定量PCR验证基因芯片结果。应用数据分析用(AgilentSoftware和Rotor-GeneReal-TimeAnalysisSoftware6.0)软件进行数据分析。实验结果：1、总RNA提取的定性定量分析质量报告:电泳结果28S、18S条带亮度接近2∶1，RNA无降解，符合芯片实验要求;2、芯片杂交结果:通过基因芯片杂交信号的分析，发现A样本，对比A1、A2差异基因筛选共2977个，其中1643个基因上调，1334个基因下调。我们发现B样本，对比B1、B2差异基因筛选共7170个，其中4264个基因上调，2906个基因下调。3、基因差异表达分析:根据方法学中提到的基因筛选、分析方法，经美国Agilent公司软件分析筛选数据后,使用美国Agilent公司提供的软件分析筛选所得到的表达变化的探针名上传到Agilent网站的NetAFFXAnalysisCenter，检索得到相应探针的注释信息，包括genetitle、genesymbol、GeneOntology，pathway信息等，将其整理为excel文档，通过excel的排序查找功能将探针信息排序分类整理，得到探针对应有明确基因名称。我们发现IL1-β基因上调，IL1-α基因下调,与其有关的信号转导通路有MAPK信号通路。A组中实验组和对照组的表达谱芯片的信号值做了差异基因表达析，得到2977个差异探针用于生物信息的后续分析。基于差异探针做了基因功能分析，得到43个显著上调的GO-Term和24个显著下调的GO-Term。基于差异探针做了信号通路分析，得到43个显著上调的Pathway和40个显著下调的Pathway。在B组中实验组和对照组的表达谱芯片的信号值做了差异基因表达分析，得到7170个差异探针用于生物信息的后续分析。基于差异探针做了基因功能分析，得到12个显著上调的GO-Term和32个显著下调的GO-Term。基于差异探针做了信号通路分析，得到23个显著上调的Pathway和17个显著下调的Pathway。最后，我们找到A组和B组属性相同的共有的显著性差异基因，命名为交集基因。我们以交集基因为研究对象做了基因功能分析，得到53个显著上调的GO-Term和27个显著下调的GO-Term。我们基于差异探针做了信号通路分析，得到39个显著上调的Pathway和17个显下调的Pathway。结论：MAPK通路的激活参与和启动了不同刺激所诱导的乳腺癌细胞凋亡；IL-1β基因表达上调，可能是激活JNK和p38MAPK信号通路，最终诱导细胞凋亡；而IL-1α基因表达下调，可能是激活JNK和p38MAPK信号通路或对肿瘤细胞分化、增殖调节最终抑制肿瘤细胞增殖。
【作者】陈国栋；
【导师】徐景伟；
【作者基本信息】吉林大学，临床医学，2014，硕士
【关键词】乳腺癌；新辅助化疗；凋亡；白介素-1；MAPK；信号通路；

【参考文献】
[1]王雯.台北市和西安市大学生婚恋观的比较研究[D].西安建筑科技大学,马克思主义理论,2013,硕士.
[2]张瑜,孙绍民,吕宝春.电力客户服务中心建设技术综述[J].电力需求侧管理,2002,06:31-32.
[3]李升伟.张晓刚的“中国式家庭”绘画创作研究[D].华中师范大学,美术学,2014,硕士.
[4]杨卉.SnO_2基乙炔气敏元件的研制[D].吉林大学,集成电路工程,2013,硕士.
[5]马喜.房地产开发项目定价风险与控制研究[D].内蒙古大学,工商管理,2014,硕士.
[6]崔婷.图对策均衡问题的算法研究及应用[D].青岛大学,计算数学,2013,硕士.
[7]李姬.城乡发展一体化背景下的基础设施建设研究[D].华中师范大学,农业推广,2014,硕士.
[8]张丽艳,王建民,李昂,陈志德.三维转换波叠前方位各向异性校正技术[J].石油地球物理勘探,2011,05:695-699+731+836+660.
[9]潘福铮.数据挖掘中的关联规则[J].湖北大学学报(自然科学版),2002,04:304-308.
[10]刘茂林.氟诱导大鼠肝组织损伤及机制的研究[D].山西医科大学,动物学,2013,硕士.
[11]程淑平.领导—部属交换对员工任务绩效和组织公民行为的影响研究[D].中国科学技术大学,工商管理,2014,硕士.
[12]黄洁.论当代中国航海精神[D].大连海事大学,马克思主义理论,2013,硕士.
[13]曲玉凤.改装车行业存在的问题及设想[J].专用汽车.1989(04)
[14]赵文焕,石润宏.世界园艺史与社会人类学视野中的花文化研究——杰克·古迪《花文化》评介[J].中国农史,2014,04:137-145.
[15]谭俊涛.黑龙江省城市创新能力差异与提升路径研究[D].中国科学院研究生院（东北地理与农业生态研究所）,人文地理学,2014,硕士.
[16]叶能胜,李建,谷学新.石墨烯类材料在毛细管电泳中的应用新进展[J].色谱,2013,04:352-354.
[17]范欢欢.原子层沉积制备氧化物光学薄膜的特性研究[D].浙江大学,光学工程,2013,硕士.
[18]冯恒昌.涡簧储能装置的设计及仿真研究[D].华北电力大学,机械设计及理论,2012,硕士.
[19]张宏彪.猪博卡病毒在我国部分地区的分子流行病学调查及其荧光定量PCR方法的建立与应用[D].南京农业大学,预防兽医学,2012,硕士.
[20]马晶晶.论福柯的话语及话语下的文学[D].河北师范大学,文艺学,2004,硕士.
[21]贾立伟.航空叶片数控加工变形分析与控制方法研究[D].西安工业大学,机械制造及其自动化,2014,硕士.
[22]周宁.泰安及仙游抽水蓄能电站水轮机层和蜗壳层除湿数值模拟[D].西安建筑科技大学,供热、供燃气、通风及空调工程,2013,硕士.
[23]许金金.复杂背景下的运动目标检测与跟踪技术研究[D].华中科技大学,控制理论与控制工程,2013,硕士.
[24]谢汝强.“读图能力”培养与高中美术鉴赏教学研究[D].山东师范大学,学科教学（专业学位）,2013,硕士.
[25]杨燕.肖邦与希曼诺夫斯基的玛祖卡舞曲对比研究[D].湖南师范大学,音乐学,2014,硕士.
[26]张旎.从功能主义视角看2001-2012政府工作报告词汇翻译[D].华中师范大学,英语语言文学,2013,硕士.
[27]陈娜.保和丸加减治疗食积内停型婴幼儿睡眠障碍的临床观察[D].浙江中医药大学,中医儿科学（专业学位）,2014,硕士.
[28]李明.基于三层结构的系统开发方法与应用研究[D].河海大学,管理科学与工程,2004,硕士.
[29]赵志洋.基于时间因素的虚拟网映射策略研究[D].杭州电子科技大学,计算机应用技术,2012,硕士.
[30]黄奕.高校植物造景方式研究[D].浙江大学,风景园林（专业学位）,2012,硕士.
[31]卜亚军.UML和设计模式在企业动态建模中的研究与应用[D].大连理工大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[32]李珅.陈白尘的干校记忆书写[D].吉林大学,中国现当代文学,2013,硕士.
[33]曹孟磊.普通数码相机获取测树信息研究[D].北京林业大学,地图学与地理信息系统,2013,硕士.
[34]杨龙.相控阵馈电网络中无源器件小型化研究[D].哈尔滨工业大学,信息与通信工程,2014,硕士.
[35]石远.miR-7-5p靶向REGγ抑制人乳腺癌细胞增殖及促进细胞凋亡研究[D].重庆医科大学,外科学,2014,博士.
[36]郑一龙.基于属性的远程证明隐私保护技术研究[D].大连海事大学,计算机科学与技术,2013,硕士.
[37]程沛林.OCT联合DTI在青光眼早期诊断中应用的研究[D].河北医科大学,眼科学,2013,硕士.
[38]张倩,王治和,张国治.基于相关系数的正、负关联规则挖掘算法[J].陕西理工学院学报(自然科学版),2005,04:39-42.
[39]张玉红,曾章慧,柴玉琼,韩凝,边红武,朱睦元.大麦黑粉菌研究进展[J].大麦与谷类科学,2014,03:1-4.
[40]崔硕.树麻雀VEGF基因克隆及其在不同组织、不同海拔的表达量研究[D].河北师范大学,生态学,2013,硕士.
[41]陆海生.JNK信号通路介导HBx对RXRα的磷酸化并促进HCC进程的分子机制[D].厦门大学,化学生物学,2014,硕士.
[42]文静.中小企业信贷融资问题及对策研究[D].沈阳理工大学,企业管理,2013,硕士.
[43]姜金利.电子政务环境下的政府信息资源共享问题研究[D].山东师范大学,行政管理,2013,硕士.
[44]周娜.浙江省经济增长与环境污染关系研究[D].杭州电子科技大学,统计学,2014,硕士.
[45]付慧中.不同耳穴组方治疗围绝经期阴虚火旺型失眠症的临床研究[D].福建中医药大学,针灸推拿学,2013,硕士.
[46]周娟.新媒体时代下的湖南传媒产业发展研究[D].湖南师范大学,政治经济学,2014,硕士.
[47]郭子杰.浅论民国时期的艺术品外交[D].南京大学,专门史,2013,硕士.
[48]汪涛.传爆药输出压力试验方法研究[D].中北大学,军事化学与烟火技术,2014,硕士.
[49]罗克龙.拱架安装机械手运动学、动力学研究[D].西南交通大学,机械设计及理论,2013,硕士.
[50]杨锦凤.水热变化对青藏公路路基纵向裂缝的影响研究[D].长安大学,道路与铁道工程,2013,硕士.