大白菜抗根肿病基因CRb的精细定位

【摘要】根肿病是由根肿菌(Plasmodiophorabrassicae)侵染的一种世界性土传病害,严重影响大白菜及其他十字花科作物生产。利用抗病基因是一种控制根肿病经济有效的方法。Piao等(2004)在发现大白菜抗根肿病基因CRb的基础上,利用大白菜’CRShinkiDH’系对其进行了初步定位。本研究在此基础上,利用抗根肿病’CRShinkiDH’系及感病青梗菜DH系‘702-5’构建了F2分离群体,并通过两个F2群体(F2-L和F2-S)的抗病性鉴定进一步验证CRb基因的遗传规律在此基础上通过开发CRb紧密连锁的分子标记,对CRb进行了精细定位。主要结果如下：1.通过对两个F2群体的抗病性调查,结果显示：在F2-L中,抗病植株有2203株,感病植株有693株；在F2-S中,抗病植株有4314株,感病植株有1486株,经卡方检验结果都符合遗传分离比,进一步证明了CRb基因是由显性单基因控制。2.利用高密度遗传图谱及BSA方法,得到CRb的一个侧翼标记cnu_m413，经过初步定位,证明cnu_m413和TCR01与CRb之间遗传距离为分别为0.51cM和0.72cM。cnu_m413和TCR01之间的物理距离约为363kb。3.我们从大白菜基因组序列中获得了cnu_m413与TCR01之间序列,并根据这段序列,设计了40个InDel标记和20个SSR标记。根据亲本间多态性鉴定的结果,有2个SSR标记和5个InDel标记有多态性。4.利用CRb两个侧翼标记cnu_m413和TCR01对两个F2群体进行重组体的筛选,共获得67个重组体。将7个新开发的标记对67个重组体进行基因型鉴定。根据基因型鉴定结果和F3家系抗病性鉴定的结果,构建了遗传图谱,将CRb基因定位到TCR79和TCR108之间,这两个标记之间的遗传距离为0.14cM。5.根据7个新开发标记扩增片段测序结果和BAC克隆序列,构建了物理图谱,在物理图谱中最近的两个标记TCR79和TCR108之间的物理距离为83kb。6.为了与CRa和CRbKato进行比较,将与这两个基因连锁的5个标记对67个重组体进行了基因型鉴定,根据基因型鉴定结果证明CRa与CRb不是等位基因,CRbKato与CRb虽然存在连锁关系,但是与CRa的连锁关系更紧密,而且CRbkato被定位在TCR01的外侧。7.根据大白菜数据库,我们获得了TCR79和TCR108之间的序列,在该区域内共有候选15个基因。
【作者】赵卓；
【导师】朴钟云；
【作者基本信息】沈阳农业大学，蔬菜学，2014，硕士
【关键词】大白菜；根肿病；根肿菌；CRb基因；

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