中国汉族人群系统性硬化的易感基因位点研究

【摘要】背景：系统性硬化症(systemicsclerosis,SSc)是一种复杂的多基因的多系统性自身免疫性疾病,其主要作用为微血管异常、免疫异常激活,并最终导致了皮肤及内脏器官的过量纤维化。SSc有着许多不同的、相互重叠且分界并不清楚的许多亚型。临床上,根据皮肤的受累程度,SSc可以可以分为两个主要的亚型：局限性系统性硬皮病(IcSSc)以及弥漫的系统性硬皮病(dcSSc).两种亚型都可以累及例如肺、心脏、肾脏、食管以及肌肉骨骼系统等内脏器官。目前SSc病因和发病机制尚不明确,但现有研究表明,遗传因素在其中占有重要的地位。国际上已先后对SSc的五十余个相关易感基因的单核苷酸多态性进行了研究,但结果并不完全一致。今年,欧美发表了多项大规模的全基因组关联扫描(genomewideassociationstudy,GWAS)研究数据,进一步发现了新的易感性位点。目的：对近年国外研究中得到的热点候选基因及其相关位点,研究中国汉族人群系统性硬化的易感基因。方法：本研究采用病例-对照研究设计。选取2008-2014年在北京协和医院皮肤科门诊就诊或随诊的系统性硬化患者,共计296例作为病例组；以及2011-2014年在北京协和医院体检中心进行健康查体的人群,共计230例作为对照组。提取外周血中的基因组DNA,采用质谱测序的方法对14个候选基因上的22个单核苷酸多态性位点进行分型检测,对相关基因的位点和基因型的频率进行统计分析,分析基因对系统性硬化易感性的影响。结果：我们最终共检测了14个候选基因上的22个单核苷酸多态性位点,其中3个单核苷酸多态性位点检测失败,19个单核苷酸多态性位点检测成功,其中RHOB-rs1062292(OR:0.620,95%CI0.413-0.932,p=0.021).CD226-rs763361(OR=0.757,95％CI0.581-0.985,p=0.038).CD247-rs2056626(OR=0.636,95%CI0.439-0.922,p=0.016).HLA-DQB1-rs6457617(OR=0.743,95%CI0.579-0.953,p=0.019)四个位点相应的等位基因在病例组和对照组间存在显著差异；CD247一rs2056626(p=0.0489).HLA-DQB1-rs6457617(p=0.0003)的基因型在病例组和对照组间存在明显差异。进一步分组后,发现NOTCH4-rs443198(OR=0.627,95％CI0.426-0.921,p=0.017)及IRF8-rs11642873(OR=2.596,95%CI1.087-6.198,p=0.026)两个位点的等位基因在dcSSc组中病例组及对照组中有显著差异,而在CD226-rs443198(OR=0.549,95%CI0.369-0.815,p=0.003).RHOB-rs1062292(OR=0.491,95%CI0.236~1.018,p=0.050).CD247一rs2056626(OR=0.447,95%CI0.223~0.894,p=0.020).HLA-DRA-rs3129882(OR=1.686,95％CI1.139~2.493,p=0.009)在IcSSc组中具有显著差异,CD226-rs763361(p=0.005)、HLA-DRA-rs3129882(p=0.027)、HLA-DQB1-rs6457617(p=0.034)的基因型在IcSSc中存在显著差异。其余所有位点均未发现在病例组和对照组间有多态性的显著性差异。结论：RHOB、CD226、CD247、HLA-DQB1可能是中国汉族人群SSc的易感基因。NOTCH4、IRF8可能是中国汉族人群dcSSc的易感基因,CD226、RHOB、CD247、HLA-DRA可能是中国汉族人群IcSSc的易感基因。SSc具有高度的遗传异质性,某些在国外人种中较为明确的易感基因如HLA-DPB1、TNFAIP3、GRB10、FAM167A-BLK、KCNA5、NLRP1等在我国人群中未显示出与疾病有显著相关性,而进行中国汉族人群SSc的GWAS研究是非常必要的。
【作者】邢泽宇；
【导师】孙秋宁；
【作者基本信息】北京协和医学院，临床医学，2014，博士
【关键词】系统性硬化；中国汉族人群；单核苷酸多态性；

【参考文献】
[1]黄伟.基于边信息提纯算法的无线视频广播策略[D].哈尔滨工业大学,计算机科学与技术,2013,硕士.
[2]周圣川.大规模城市场景图形图像混合建模与视觉无损渲染技术[D].中国海洋大学,2014.
[3]冯慧芳.我国基层政治人才开发与培养新途径研究[D].河北师范大学,政治学理论,2014,硕士.
[4]何米娜.负载型茂钛催化剂的合成及催化烯烃聚合反应的研究[D].吉林大学,应用化学,2014,硕士.
[5]王琳.微波ECR等离子体增强磁控溅射制备氮化铝薄膜[D].大连理工大学,等离子体物理,2013,硕士.
[6]侯镔娓.杨燕迪歌剧评论文本探析[D].天津音乐学院,音乐学,2014,硕士.
[7]董京.柔性有机场效应晶体管（OFET）器件性能的研究[D].东北农业大学,农业电气化与自动化,2013,硕士.
[8]李太航,黄倩,赵红,沈祖梁.Fuzzy语义推理的自学习算法[J].自动化学报,1984,04:324-329.
[9]宋晔.基于共享心智模型的虚拟学习团队学习过程模型研究[D].华中师范大学,教育技术学,2013,硕士.
[10]郭毅鹏.近40年青藏高原地区水汽循环变化特征研究[D].兰州大学,气象学,2013,硕士.
[11]江培培.任务驱动教学法在初中英语阅读教学中的应用研究[D].宁夏大学,教育（专业学位）,2014,硕士.
[12]陈景新,王云峰.我国劳动密集型产业集聚与扩散的时空分析[J].统计研究,2014,02:34-42.
[13]朱伟.从“依侍主义”到“新合作主义”：台湾地方派系的嬗变研究[D].华中师范大学,地方政府学,2012,硕士.
[14]刘建军.配电自动化系统通信方式的研究[J].计算机与网络.2003(08)
[15]杨淼淼.红外侦察告警设备作用距离等效折算方法研究[D].电子科技大学,电子与通信工程（专业学位）,2012,硕士.
[16]吴金辉.钢筋钢纤维混凝土梁疲劳性能试验研究及数值分析[D].郑州大学,结构工程,2013,硕士.
[17]许庚.基于内置电加热方式的路面表面物理除冰雪技术研究[D].哈尔滨工业大学,交通运输工程,2013,硕士.
[18]阮氏秋恒.现代汉语疑问代词“什么”与越南语“gì”比较研究[D].广西民族大学,语言学及应用语言学,2013,硕士.
[19]李健.多孔铜的制备及其与高氯酸铵的反应机理研究[D].南京理工大学,军事化学与烟火技术,2012,硕士.
[20]江道灼,吕翔,杨贵玉.一种同步时标可自由设定的新型相量测量装置[J].电力系统自动化,2008,03:56-60.
[21]任瑾钰.杜威道德教育思想及其对中国高校思想政治教育的借鉴[D].东北石油大学,思想政治教育,2013,硕士.
[22]牛淑敏.分数跳—扩散运动下的奇异期权定价[D].新疆大学,概率论与数理统计,2013,硕士.
[23]刘汉杰.IDS的比较分析与数据采集[J].信息技术,2004,05:8-10.
[24]胡亚虎.杨树对干旱区重金属污染农田土壤的修复研究[D].兰州大学,环境科学,2013,博士.
[25]刘瑞瑞.基于遗传模拟退火算法的三维离线装箱优化问题研究[D].吉林大学,物流工程,2014,硕士.
[26]韩晓东.山西高校国家自然科学基金竞争力研究[D].山西大学,科学技术哲学,2004,硕士.
[27]王真理,李衍达.利用小波变换压缩地震勘探数据[J].石油地球物理勘探,1995,01:86-90+146.
[28]李振龙.几种稀土掺杂化合物的上转换性质及其对TiO_2光催化性能的增强[D].湘潭大学,凝聚态物理,2012,硕士.
[29]汪璟玢,郭朝珍.分布式空间数据仓库技术研究[A].中国仪器仪表学会.全国第十五届计算机科学与技术应用学术会议论文集[C].中国仪器仪表学会:,2003:5.
[30]刘霞.QRS积分预测ST段抬高型心肌梗死急诊PCI近期预后的意义[D].大连医科大学,内科学,2012,硕士.
[31]张炳达,姚浩.智能变电站过程层故障仿真装置[J].电力系统自动化,2014,10:90-94.
[32]周小甜.传播学视角下的城市景观构建[D].浙江大学,传播学,2013,硕士.
[33]江硕儒（Shuo-JuChiang）.台湾牛樟芝与经方真武汤治疗糖尿病临床研究[D].广州中医药大学,中医临床基础,2014,博士.
[34]高照阳.基于温室微灌的双湿度（土壤和空气湿度）自动测控系统设计与研究[D].河南农业大学,农业机械化工程,2004,硕士.
[35]林娜.石墨烯-RuO_2复合材料的制备及在超级电容器中的电化学性能[D].天津大学,应用化学,2013,硕士.
[36]崔凯楠,郑晓龙,文丁,赵学亮.计算实验研究方法及应用[J].自动化学报,2013,08:1157-1169.
[37]钟伟斌.基于有限元分析的轮毂轴承单元轴铆合工艺优化[D].华南理工大学,车辆工程,2014,硕士.
[38]李金鹏.基于案例的对外汉语课堂教学急智策略研究[D].鲁东大学,汉语国际教育（专业学位）,2013,硕士.
[39]安钊.安倍第二次执政加强首相外交决策权的研究[D].外交学院,外交学,2014,硕士.
[40]梁变.基于指纹识别的SIMS的设计与实现[D].西安电子科技大学,计算机应用技术,2011,硕士.
[41]刘少华.河北山东经济增长比较分析[D].东北财经大学,统计学,2012,硕士.
[42]王飞.大射电望远镜AB轴与精调平台运动控制系统研究[D].西安电子科技大学,机械制造及其自动化,2012,硕士.
[43]苏芳迪.钢板混凝土组合构件受弯性能研究[D].哈尔滨工业大学,结构工程,2013,硕士.
[44]丁志忠.我国高校创业教育现状分析及对策的探讨[J].企业改革与管理,2015,04:216.
[45]于发发.STT-MRAM信息存储机理仿真研究[D].华中科技大学,半导体芯片系统设计与工艺,2013,硕士.
[46]龙志东.GSM寻呼瓶颈分析及解决寻呼删除技术研究[D].南京邮电大学,电子与通信工程（专业学位）,2012,硕士.
[47]窦毅.CRM的四种吃法[J].互联网周刊,2002,11:34-39.
[48]魏慧.知识管理视阈的城建档案管理问题研究[D].湖北大学,档案学,2012,硕士.
[49]习觉之.对非汉字文化圈初级学习者汉字教学的课堂构建[D].湖南师范大学,汉语国际教育（专业学位）,2013,硕士.
[50]李敏敏.杀螨剂丁氟螨酯残留分析及环境降解行为研究[D].东北农业大学,农药学,2013,硕士.