甘蓝型油菜抗菌核病QTL定位

【摘要】菌核病是我国油菜三大病害之一,每年可导致30%-50%的减产,严重发病时可导致80%以上减产。因此,提高甘蓝型油菜菌核病抗性是油菜育种的主要目标之一。但目前对菌核病的遗传机制及抗病机理研究得还不清楚,而且生产上往往早熟的材料容易感染菌核病。为了解析油菜对菌核病的遗传机制,分析菌核病抗性与开花期是否存在相关性,为在育种中克服抗菌核病与早熟的矛盾提供参考,本研究利用菌核病抗性及开花期差异都较为明显的两个材料H100(抗)和D126(感)构建DH群体,并且从中随机选择163个株系构建遗传连锁图谱,调查菌核病抗性以及开花期,最终定位抗菌核病及初花期QTL。主要结果如下：1、利用SSR和InDel标记构建了一张甘蓝型油菜遗传连锁图。该图谱共有467个标记位点,包括19个连锁群；图谱遗传距离总长2243.4cM,标记间平均距离为4.86cM。遗传图谱上共有168个标记表现为偏分离(p<0.01),占总标记数的36%。其中有92个标记偏向H100(54.8%),76个标记偏向于D126(45.2%)。2、2014年考察了成株期茎秆菌核病抗性及初花期。双亲菌核病抗性差异显著,其中H100接种后7d病斑均值为3.lcm,D126为6.85cm。DH群体病斑介于0.59至13.06cm之间,系间差异达到极显著,呈现连续分布且出现了超亲分离。H100和D126初花期分别为154.38和160.5天,差异极显著。DH群体初花期介于120-167.5天之间,均值为151.8天。其中7个株系的初花期是小于125天；8个株系的初花期是在165天以上。菌核病抗性和初花期呈现极显著负相关,相关系数为-0.53,表明在一定程度,晚熟材料比早熟材料更抗病。3、本研究中共定位出9个QTL。4个与茎秆抗性(SR)有关,分别命名为SRA2、SRA3、SRC2a和SRC2b,分布于A2、A3、C2和C2连锁群上,解释的表型变异分别为：13.80%、8.50%、8.70%、8.00%,LOD值分别为6.22、3.76、3.61、3.82,其中SRA2、SRC2a和SRC2b的抗性贡献来自于抗性亲本H100。检测到5个控制花期的QTL位点,分布于A2、A3、A6和C8上,解释表型变异5.6-25.8%。FTA2解释表型变异率最高,达25.80%,为主效QTL。只有A3上的两位点FTA3a、FTA3b具有正向的加性效应(即贡献来自于亲本D126),包括主效QTL在内的其余QTL的贡献均来自H100(较早开花亲本)。其中SRA3与FTA3a置信区间重叠,可在一定程度上解释菌核病抗性和初花期呈现极显著负相关。4、使用InDel标记有两大优势,体现在：1).准确定位连锁群所在染色体；2).确定定位QTL的物理位置,快速鉴定候选基因。本研究后期使用InDel标记加密到连锁群后,发现先前定义连锁群时将A4和C4定位错误了。根据InDel标记的物理位置,我们确定了开花期主效QTLFTA2的物理位置,并在该区间内找到了一个与花期相关的候选基因BnFLCo
【作者】周李鹏；
【导师】周永明；
【作者基本信息】华中农业大学，作物遗传育种，2014，硕士
【关键词】甘蓝型油菜；遗传连锁图谱；InDel；菌核病；初花期；QTL定位；

【参考文献】
[1]刘明源,贾冰怀,蔡世袭,白二宇,彭克巽.走马观花话台湾[J].北京政协.1994(02)
[2]吴江瑛.西安市道路路域土壤重金属赋存形态研究[D].长安大学,环境工程,2013,硕士.
[3]刘梦颖.《大脑》（第五章、第六章）翻译报告[D].四川外国语大学,翻译（专业学位）,2014,硕士.
[4]何勤奋,史维.利用超稳定性理论证明随机自适应控制算法的稳定性[J].自动化学报,1990,01:66-70.
[5]崔修亮.生物网络分析若干关键技术及其应用研究[D].中国人民解放军军事医学科学院,药物分析学,2014,博士.
[6]袁晓亮.饱和氢气生理盐水对高龄大鼠肾脏衰老影响的研究[D].苏州大学,外科学,2013,硕士.
[7]张君.养老服务业盈利模式研究[D].湖南师范大学,工商管理（专业学位）,2014,硕士.
[8]贺广兴.城市热岛与空气污染物特性分析及其影响参数研究[D].中南大学,土木工程,2014,博士.
[9]罗升.在石英和多孔α-Al_2O_3基体上制备碳纳米管膜[D].天津大学,2010.
[10]魏小雨.北方重工集团财务风险控制研究[D].吉林大学,工商管理,2012,硕士.
[11]乔见.“人与组织匹配”在成长性企业招聘的应用研究[D].北京体育大学,体育人文社会学,2013,硕士.
[12]朱超.SPEEK/PVA改性棉织物的制备及其污染物消除性能研究[D].浙江理工大学,纺织化学与染整工程,2014,硕士.
[13]谢克.碳基纳米笼的超级电容器性能研究[D].南京大学,2012.
[14]翁启献,段裘龙.〈八〉主机选型与轴系设计[J].江苏船舶.1990(01)
[15]胡琳.论公安情报信息收集中的隐私权保护[D].大连海事大学,法律,2012,硕士.
[16]程云翔.基于供应链协同的契约联盟与供应链创新类型的实证研究[D].重庆大学,产业经济学,2014,硕士.
[17]庾锐光.舒曼《狂欢节》演奏释义[D].西安音乐学院,钢琴教学与演奏,2013,硕士.
[18]宾彬.郴州市北湖区电子政务建设研究[D].湖南大学,公共管理,2014,硕士.
[19]李天平.IEEE 802.15.4区分服务机制研究[D].吉林大学,通信与信息系统,2014,硕士.
[20]章武滨.论消费条件及其对消费的影响[D].浙江工商大学,区域经济学,2013,硕士.
[21]崔骅.视频目标跟踪系统可复用框架研究与设计[D].西北工业大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[22]傅万四.竹质OSB削片技术及工艺学研究[D].东北林业大学,2007.
[23]魏宁.高性能电磁屏蔽织物的研究[D].上海工程技术大学,服装设计与工程,2011,硕士.
[24]陈晓楠.鞍山新型工业化发展道路研究[D].大连理工大学,工商管理,2003,硕士.
[25]花露.稀土化合物催化邻氨基肉桂酸酯与异硫氰酸酯的选择性加成反应研究[D].苏州大学,有机化学,2013,硕士.
[26]常富蓉.基于链接分析的藏文Web社区发现算法研究[D].西北民族大学,计算机软件与理论,2012,硕士.
[27]李淑云.社会工作介入少数民族流动妇女扫盲教育研究[D].兰州大学,社会工作（专业学位）,2014,硕士.
[28]唐容.支持非数值型测试用例自动生成的抽象内存建模技术研究[D].北京邮电大学,计算机科学与技术,2013,硕士.
[29]张海萍.环境变化对广东省渔业经济影响的实证研究[D].广东海洋大学,农业经济管理,2013,硕士.
[30]荆宏侠.从小说“试验田”到革命文艺阵地[D].西南大学,中国现当代文学,2013,硕士.
[31]鱼小眉.社会主义核心价值体系大众化的路径研究[D].西北师范大学,马克思主义中国化研究,2013,硕士.
[32]姜春兰.农村初中古典诗歌教学现状调查与对策研究[D].西北师范大学,教育,2014,硕士.
[33]张勇军.基于法矢约束的散乱点曲面造型方法研究[D].西安科技大学,应用数学,2014,硕士.
[34]高洁.六盘水师范学院教务系统的设计与实现[D].电子科技大学,电子工程（专业学位）,2012,硕士.
[35]周梦琼.美国Texas州高中健康教育教材《Glencoe Health》研究[D].华东师范大学,课程与教学论,2013,硕士.
[36]霍伟,高为炳,程勉.一种新的机器人模型及其控制算法[J].自动化学报,1994,03:278-285.
[37]杨慧.交际翻译视角下的医学报告汉译[D].中国海洋大学,英语笔译（专业学位）,2014,硕士.
[38]韩洁.MicroRNA-145在耐药的上皮性卵巢癌中表达水平的相关研究[D].河北医科大学,妇产科学,2014,硕士.
[39]韩思奇.曲妥珠单抗与塞卡替尼在胃癌中的抗肿瘤作用及其机理研究[D].中国人民解放军医学院,肿瘤学,2013,硕士.
[40]曹青.通识教育理论背景下的大学英语课程设计研究[D].河北科技大学,英语语言文学,2012,硕士.
[41]刘少丽.JF化工企业文化的现状、问题及对策建议[D].宁夏大学,工商管理（专业学位）,2014,硕士.
[42]何磊.人性化开启方式在包装设计中的应用研究[D].杭州师范大学,艺术学,2013,硕士.
[43]杨逸.寿光市产业转型与空间重构研究[D].北京建筑大学,城乡规划学,2013,硕士.
[44]王祥.廉政文化及其建设探析[D].齐鲁工业大学,马克思主义中国化研究,2014,硕士.
[45]梁亚平.根据牙齿的多项增龄指标推断年龄的研究[D].山西医科大学,法医学,2003,硕士.
[46]朱守喜.无线数据链宽带信息传输技术研究与实现[D].北方工业大学,电路与系统,2014,硕士.
[47]李郑波.甘肃省建设工程混凝土消耗量定额编制与研究[D].兰州理工大学,结构工程,2013,硕士.
[48]陈晶晶.云南省省直管县财政体制改革发展研究[D].云南大学,公共管理学,2012,硕士.
[49]陈亚东,林为民,张涛,曾荣,杨维永.基于x86的高速加密卡异步并行驱动设计[J].电力系统自动化,2010,10:93-96.
[50]王健.大量程脉冲变换电路测试系统的研制[D].西安理工大学,电气工程,2003,硕士.