一个大白猪群肌纤维性状的测定及其与候选基因SNP的关联分析

【摘要】生猪养殖产业在我国畜牧业中占据着十分重要的地位,猪肉成为我国主要的肉制品来源。随着人们生活水平的提高,对猪肉的需求不再仅仅是量的满足,更大的是对肉品质要求的改善。猪肉品质的改善已经成为猪遗传育种学研究的热点问题。肌纤维是构成肌肉的基本单位,肌纤维特性直接影响到肉质的好坏。肌肉的食用特性(嫩度、风味、多汁性)与肌纤维数目、肌纤维直径、肌纤维面积、肌纤维类型以及肌内脂肪(IMF)含量密切相关。通过研究个体肌纤维性状的差异,从分子遗传角度找到影响肌肉发育的相关基因,能更好地在实践中指导育种,取得最佳的经济效益。本研究基于一个纯种大白资源群体,利用HE染色法对猪群肌纤维直径、面积进行测定,结合分子生物学、生物统计学以及群体遗传学等方法对Lpin1、BTG3基因进行了SNP检测及与肌纤维短径、长径、直径、肌纤维面积等性状的关联分析。同时通过免疫组化方法用ImageProPlus6.0图像处理软件测得了11个个体的肌纤维快慢肌比例,并且通过Real-TimePCR技术验证了这11个个体的慢肌narker基因MYH7的表达量。取得如下结果：(1)测定了118头纯种大白背最长肌肌纤维性状指标。数据显示,个体肌纤维短径平均数为51.26±8.46um,长径平均数为79.42±12.86um,直径平均数为67.30±10.76um,面积平均数为2976.14±973.31um2；个体间肌纤维短径变异系数为17%,长径和直径变异系数均为16%,而肌纤维面积变异系数较大,为33%。(2)对肌纤维性状指标与猪胴体性状以及肉质性状指标进行了表型相关分析。结果显示,面积与直径的偏相关系数为0.5910,呈极显著正相关。滴水损失与pHl均值的偏相关系数为0.3038,两者呈极显著正相关；肌内脂肪与pHl均值的偏相关系数为-0.1927,两者呈显著负相关。(3)在猪Lpinl基因第2外显子93位存在C>T多态位点,属于同义突变。性状关联分析结果发现该位点同肌纤维直径、肌纤维面积均不存在显著相关。(4)在猪BTG3基因第5外显子存在C>T多态位点,使得编码的氨基酸由脯氨酸(P)变为丝氨酸(S)。性状关联分析结果发现该位点同肌纤维直径、肌纤维面积均不存在显著相关,但该位点与6-7胸椎间背膘厚、胸腰椎结合处背膘厚、pHl均值极显著相关(p<0.01)；与第十肋骨处背膘厚显著相关(p<0.05)；TT型个体肌内脂肪含量大于CC型,且差异显著(P<0.05)。(5)通过免疫组化,对11头猪背最长肌的快慢肌纤维数目比例进行了检测,同时对这些组织的慢肌标志基因MYH7表达水平进行了绝对定量。相关分析结果发现,MYH7基因表达水平与快慢肌比例呈极显著相关。
【作者】张贝贝；
【导师】赵书红；
【作者基本信息】华中农业大学，动物遗传育种与繁殖，2014，硕士
【关键词】大白猪；HE染色；肌纤维直径；肌纤维面积；SNP；IHC；快慢肌比例；肉质性状；

【参考文献】
[1]张坤.水稻浮床水体细菌群落特征和好氧反硝化菌的分离[D].南京农业大学,微生物学,2012,硕士.
[2]程继坤.智能化整车称重台的设计[D].山东大学,机械工程（专业学位）,2012,硕士.
[3]孟洪宇.基于条件随机场的《伤寒论》中医术语自动识别研究[D].北京中医药大学,中医基础理论,2014,硕士.
[4]李梦凡.《英语语言传记》（第1章）翻译报告[D].河南科技大学,英语笔译（专业学位）,2014,硕士.
[5]邹伟嘉.基于物联网的城市轨道交通客流特征分析系统的设计与实现[D].北京交通大学,2014.
[6]陈学敏.苏宁电器潍坊分公司售后服务管理系统的设计与实现[D].山东大学,软件工程（专业学位）,2012,硕士.
[7]张志霞.基于GUI的C/S系统软件测试自动化技术研究与实现[D].南京航空航天大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[8]彭莎莎.多肽水凝胶对支架材料生物相容性和骨引导性影响的研究[D].南京医科大学,口腔临床医学,2013,硕士.
[9]凌云峰.构件技术在CRM中的应用研究[D].南京航空航天大学,电力电子与电力传动,2004,硕士.
[10]刘源.基于多元EMD的BCI信号处理研究[D].燕山大学,通信与信息系统,2013,硕士.
[11]王健合.基于SSH框架的员工管理系统[D].南昌大学,计算机技术,2012,硕士.
[12]张影.中国企业跨国并购融资问题研究[D].沈阳工业大学,会计学,2004,硕士.
[13]徐祖应.光纤非线性系数和受激喇曼散射增益系数测试研究[D].华中科技大学,光电信息工程,2013,硕士.
[14]徐雪霏.黄多孔菌表达漆酶最佳培养条件的优化研究[D].吉林农业大学,食品科学,2012,硕士.
[15]刘兵,董峰.直播星远程互动教育服务系统建设方案[J].通信世界.2003(35)
[16]薛静宜.浅议班主任工作要“四抓”[J].中国校外教育.
[17]颜昌盛,高明星,赵珅,陈琦.基于Hadoop的铁路货运历史数据分析解决方案[J].中国铁路,2014,04:94-97.
[18]王悦.以软件产业促进大连产业结构优化和城市经济发展[D].东北财经大学,2005.
[19]王珊珊.单通道角跟踪接收机基带信号处理技术[D].西安电子科技大学,电子与通信工程,2012,硕士.
[20]韩文秀,丁荣贵.一种R＆D项目选择的人工智能方法[J].控制与决策,1995,01:27.
[21]王瑞果.甜叶菊F_1群体关联分析及其不同品系遗传多样性的研究[D].浙江大学,作物学（专业学位）,2013,硕士.
[22]张大伟.基于石墨烯和聚苯胺纳米复合材料的电化学生物传感研究[D].西北大学,2013.
[23]格日乐图.关于现代人类起源地的历史研究[D].内蒙古师范大学,科学技术史,2012,硕士.
[24]陈竹睿.编码FLC-FLAG和SVP-HA标签蛋白表达载体转化芥菜的研究[D].西南大学,蔬菜学,2013,硕士.
[25]许慧.Modbus与CAN-bus协议转换器研究[D].东北大学,测试计量技术与仪器,2010,硕士.
[26]李宗耘.高灵敏近同时分析多种“瘦肉精”残留的电化学发光免疫传感器阵列[D].西南大学,药物分析学,2013,硕士.
[27]方青.参麦注射液对大鼠急性肺损伤疗效的观察[D].吉林大学,兽医,2012,硕士.
[28]杨静.四通道高温超导心磁图诊断冠心病的临床初步研究[D].山西医科大学,心血管内科学,2013,硕士.
[29]凌琳.低能Ar~+束介导的家蚕卵转基因技术研究[D].安徽农业大学,特种经济动物饲养,2012,硕士.
[30]伍程杰,龚晓南,俞峰,楼春晖,刘念武.既有高层建筑地下增层开挖桩端阻力损失[J].浙江大学学报(工学版),2014,04:671-678.
[31]王海录.体绘制下虚拟内窥镜系统自动漫游技术研究[D].内蒙古科技大学,计算机应用技术,2014,硕士.
[32]姚瑾.初中生对一元二次方程的理解[D].华东师范大学,课程与教学论,2013,硕士.
[33]彭鹏.旋毛虫与伪旋毛虫肌幼虫时期排泄分泌抗原的对比分析与鉴定[D].吉林大学,预防兽医学,2014,硕士.
[34]姚茂飞.镱原子光钟的黑体辐射频移问题的研究[D].华东师范大学,光学,2013,硕士.
[35]张堃.基于Copula-GARCH模型的股指期货与ETF套期保值的实证分析[D].华中科技大学,金融,2013,硕士.
[36]张卫华.儿童文学游戏性的文本解析[D].浙江师范大学,中国现当代文学,2004,硕士.
[37]王婷婷.滇中经济区经济增长差异与收敛状况研究[D].云南财经大学,区域经济学,2013,硕士.
[38]孟令维.家族上市公司金字塔型股权结构对盈余管理的影响[D].兰州理工大学,会计学,2012,硕士.
[39]马丽娜.基于评价理论的中文仲裁裁决书情态动词人际意义研究[D].重庆大学,外国语言学及应用语言学,2014,硕士.
[40]殷帅.肾透明细胞癌组织中miR-34a和miR-34b/c基因CpG岛甲基化水平的变化及意义[D].苏州大学,泌尿外科学（专业学位）,2013,硕士.
[41]李丽娜.网络化销售管理无成本部署客户端系统[J].互联网周刊,2001,29:47.
[42]李茗.铅烧结过程物料平衡的控制[J].冶金自动化,1989,06:12-16.
[43]陈会文.脉冲微分系统与离散Hamilton系统解的存在性研究[D].中南大学,数学,2014,博士.
[44]沈畏.非诺贝特通过抑制TLR-4/NF-κB信号通路来抑制眼部炎症[D].吉林大学,微生物与生化药学,2014,硕士.
[45]张峰.髋关节假体柄的四轴精密铣削的研究[D].华南理工大学,机械工程,2012,硕士.
[46]徐忠.林和平电视剧人物形象分析[D].南京师范大学,电影学,2012,硕士.
[47]刘成章.加强技术装备管理提高企业技术水平[J].工业技术进步.1998(01)
[48]高文秀,王洪磊,李慎敏.分子动力学模拟研究纳米碳管中甲醇-水混合溶液的结构与输运性质[J].物理化学学报,2014,09:1625-1633.
[49]伍春霞.中英文化的不对等性及对语言和英语教学的影响[D].湖南师范大学,学科教学,2003,硕士.
[50]刘耀宗.基于数据仓库的物流信息系统[D].南京理工大学,2004.