湖羊、东湖杂交羊MC4R、POMC、CSN3、β-lg基因多态性及其与生长性状的相关性研究

【摘要】本论文以湖羊和东湖杂交羊（东弗里升羊和湖羊的杂交一代）2个群体共298个个体为研究材料,在分析两个群体生产性能的基础上,采用DNA池PCR扩增引物测序,发现了MC4R、POMC、CSN3、β-lg基因的34个碱基突变位点,运用PCR-RFLP、CRS-PCR-RFLP技术对其中7个单核苷酸多态位点（SNPs）的遗传变异进行检测。同时,将这些SNPs位点与两个群体体重和体尺指标进行关联性分析,以筛选与绵羊经济性状相关的分子标记,为今后培育乳肉兼用型绵羊新品种提供试验依据。主要研究结果如下：1、湖羊与东湖杂交羊产肉和产奶性能分析分析湖羊与东湖杂交羊六月龄的产肉性能（各10只）和产后20d的产奶指标（各10只）,发现湖羊的净肉率显著高于东湖杂交羊（P<0.05）,宰前活重、胴体重、屠宰率、肉骨比、肉色、pH值、失水率、眼肌面积等性状方面,两者之间差异不显著（P>0.05）。乳成分分析结果表明：两者在乳脂率、乳蛋白和乳糖量方面差异极显著（P<0.01）,东湖杂交羊的乳脂率极显著高于湖羊,而乳蛋白、乳糖量则相反。2、湖羊、东湖杂交羊MC4R基因多态性及其与生长性状的相关性研究本试验采用DNA池PCR扩增产物测序的方法共检测到MC4R基因的10个SNPs（NM001126370）:g.110C/G、g.222C/T、g.306G/A、g.548C/T、g.706C/A、g.732C/G、g.951G/A、g.1229G/A、g.1267G/A和g.1291G/C,其中除g.1229G/A位点在文献中有报道外,其余均未见报道。g.222C/T、g.306G/A、g.548C/T、g.706C/A、g.732C/G和g.951G/A位于编码区,除548位点C/T和732位点C/G突变为错义突变（分别导致苏氨酸变为蛋氨酸,异亮氨酸突变为蛋氨酸）外,其余突变均为同义突变。g.110C/G、g.1229G/A、g.1267G/A和g.1291G/C位于非编码区。应用PCR-RFLP和CRS-PCR-RFLP技术分别对编码区的g.306G/A、非编码区的g.1267G/A和编码区的g.548C/T、g.706C/A多态位点进行分析,结果表明：两个群体除在306位点属于中度多态外,在其余三个位点均属于低度多态,且四个位点都偏离了Hardy-Weinberg平衡状态。分析这四个突变位点的多态性与体重的相关性,发现除306位点与体重性状无关外,其余位点均与体重相关。湖羊群体中g.548C/T多态位点CT基因型个体的六月龄体重和4-6月龄平均日增重显著高于CC型个体（P<0.05）；706位点CA型个体的6月龄重体和4-6月龄平均日增重极显著高于CC型个体（P<0.01）,AA型个体的6月龄重和CA型个体的4-6月龄平均日增重显著高于CC型个体（P<0.05）；1267位点GA型个体的2月龄断奶重、4月龄重极显著高于GG基因型个体（P<0.01）,GA型个体的6月龄重显著高于GG型个体（P<0.05）。东湖杂交羊群体中g.548C/T位点CT基因型的4月龄重、6月龄重极显著高于CC型个体（P<0.01）,CT基因型的4-6月龄平均日增重显著高于CC型个体（P<0.05）；706位点AA型个体的初生重、2月龄断奶重、6月龄重和4-6月龄平均日增重均极显著高于CC型个体（P<0.01）；1267位点GA基因型个体的6月龄重极显著高于GG型个体（P<0.01）,GA型个体的4月龄重显著高于GG型个体（P<0.05）。分析这四个突变位点的多态性与四月龄体尺性状的相关性,发现湖羊群体306多态位点AA型个体的腰角宽显著高于CA型个体（P<0.05）；548位点CT型个体的体长极显著高于CC型个体（P<0.01）,TT基因型个体的胸围极显著高于CC和CT型个体（P<0.01）；706位点CA型个体的体长显著高于CC型个体（P<0.05）；1267位点GA型个体的体高、尻高显著高于GG型个体（P<0.05）。东湖杂交羊群体306位点GG和GA基因型个体的管围极显著高于AA型个体（P<0.01）；548位点CT型个体的体高（P<0.01）和尻高（P<0.05）分别极显著和显著高于CC型个体；706位点AA基因型的体高、体长、腰角宽和管围均极显著高于CC型个体（P<0.01）,AA型个体的胸深显著高于CC型个体（P<0.05）；1267位点GA型个体的体高和管围显著高于AA型个体（P<0.05）。3、湖羊、东湖杂交羊POMC基因多态性及其与生长性状的相关性研究本试验采用DNA池PCR扩增产物测序技术检测到POMC基因第3外显子上的2个SNPs（NM001009266.1）:g.273T/C和g.456G/A。对273位点进行PCR-RFLP分析,发现该多态位点在湖羊群体中表现为中度多态,而在东湖杂交羊群体中未检测到CC基因型,表现为低度多态,且该位点在两个群体中均未达到Hardy-Weinberg平衡。分析273位点的多态性与体重及四月龄体尺性状的相关性,发现湖羊群体中CC基因型个体的2月龄断奶重、四月龄尻高及TC基因型个体四月龄体长和管围均显著高于TT型个体（P<0.05）；CC基因型个体的4月龄重、6月龄重极显著高于TT和TC基因型个体（P<0.01）；CC基因型个体的四月龄体高和体长极显著高于TT型个体（P<0.01）,且显著高于TC基因型个体（P<0.05）。此外,CC型个体的管围极显著高于TT基因型个体（P<0.01）。东湖杂交羊群体中TC基因型个体的2月龄断奶重、4月龄重及四月龄体高、体长、胸深和管围都显著高于TT型个体（P<0.05）,TC型个体的6月龄重极显著高于TT型个体（P<0.01）。4、湖羊、东湖杂交羊CSN3、β-lg基因多态性及其与生长性状的相关性研究本试验采用DNA池PCR扩增产物测序技术检测到CSN3基因的外显子4的1个SNP（NM001009378.1）:g.237T/C和β-lg基因的启动子区的21个SNPs（FR821261.1）:g.167A/G、g.213T/C、g.235C/T、g.237C/T、g.239T/G、g.333G/T、g.357T/C、g.368T/G、g.378C/T、g.415A/G、g.517C/A、g.700G/C、g.711G/A、g.1384G/A、g.1573G/A、g.1603C/T、g.1620A/G、g.1652C/G、g.1671T/C、g.1701A/C和g.1902A/T。应用PCR-RFLP和CRS-PCR-RFLP技术分别对CSN3基因的g.237T/C和β-lg基因的g.1652C/G进行分析,发现g.237T/C位点在湖羊群体表现低度多态,在东湖杂交羊群体表现中度多态；g.1652C/G位点在该多态位点在两个群体中都表现低度多态；这两个位点在两个群体中都显著偏离Hardy-Weinberg平衡（P<0.05）。分析CSN3基因237位点的多态性与体重及四月龄体尺性状的相关性,发现该多态位点与两个群体的生产性状均无显著性差异（P>0.05）。分析β-lg基因1652位点的多态性与体重及四月龄体尺性状的相关性,发现湖羊群体CC型个体的4月龄重和四月龄体高极显著高于GG基因型个体（P<0.01）,CC和GG型个体的四月龄胸围、腰角宽及管围显著高于CG型个体（P<0.05）；东湖杂交羊群体GG型个体的6月龄重和四月龄体高均显著高于CC型个体（P<0.05）,GG型个体的四月龄胸围和尻高显著高于CG基因型个体（P<0.05）。
【作者】王春玲；
【导师】茆达干；
【作者基本信息】南京农业大学，动物遗传育种与繁殖，2013，硕士
【关键词】湖羊；东湖杂交羊；MC4R基因；POMC基因；CSN3基因；β-lg基因；多态性；生长性状；

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