蛋白质二级结构预测的一种新的编码方式

【摘要】提出了一种基于结构特征的蛋白质二级结构预测方法。先对氨基酸的理化特性进行主成分分析,提取出主要影响因素,并融合成3位编码。接着,在原有3位编码基础上加入3位氨基酸在特定二级结构中的倾向因子。编码完成后,使用支持向量机方法进行预测。实验结果表明,改进后的编码方式优于单纯做主成分分析得到的3位编码和5位编码方式,可以有效地用于蛋白质二级结构预测。
【作者】吴玉明；
【机构】浙江理工大学；
【关键词】编码方式；主成分分析；倾向因子；支持向量机；

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