农药氟虫腈作用下斑马鱼microRNA-155对cyb561d2的调控作用研究
【摘要】MicroRNA(miRNA)是一类长为20~24nt的单链非编码小分子RNA,主要存在于真核生物中,具有组织特异性、无开放阅读框等特点,在转录或翻译水平调控基因表达,参与细胞增殖、分化、凋亡,并与炎症、肿瘤等疾病的发生、发展密切相关。环境毒理学研究表明,当生物细胞或组织暴露于环境化学物质时,会引起相关miRNA的表达发生变化,进而导致其靶基因表达发生变化。因此,有必要明确环境化学物质、miRNA及其靶基因三者间的作用关系。在环境毒理学研究和环境监测中,miRNA可作为识别环境中化学物质基因毒性和致癌性的生物标记物,并可用于预测环境化学物质对生物体的毒性。课题组使用基因芯片方法研究了三唑磷微乳剂、氟虫腈微乳剂及两者的混合物对斑马鱼(Daniorerio)miRNA表达的影响,结果显示219条待测miRNA中,21条miRNA表达发生了变化,其中氟虫腈作用可导致斑马鱼miR-155的显著下调。在本研究中,我们通过生物信息学方法,预测cyb561d2为miR-155的一条潜在靶基因,而cyb561d2是细胞色素b561的家族成员,主要功能为跨膜电子传递、抗环血酸的再生和平衡并参与细胞防御以及应答环境化学物质的刺激。我们將斑马鱼暴露于不同浓度的氟虫腈中,通过荧光定量PCR发现,随着氟虫腈处理浓度从0.015mg/L提高到0.480mg/L,斑马鱼miR-155表达量持续下调,从0.96下调至0.24,而cyb561d2表达量则从1.94倍升高至4.17倍;采用Westernblot检测cyb561d2蛋白表达量,随着氟虫腈处理浓度从0.015mg/L提高到0.480mg/L,其表达量从1.46倍升高至3.45倍。为验证信息学手段的预测结果,并解释氟虫腈处理的共表达变化,我们成功构建四种重组海肾荧光素酶载体:1)包含全长3’-UTR序列;2)仅包含miR-155推定结合位点及其邻近核苷酸序列;3)包含3个首尾串联的miR-155推定结合位点序列;4)包含敲除miR-155推定结合位点的3’-UTR序列,并分别与pGL3-control、miR-155mimic共转染进入293T细胞,利用双荧光素酶报告基因法验证了斑马鱼cyb561d2的3’-UTR存在miR-155直接结合位点,为miR-155的靶基因。为明确斑马鱼miR-155对cyb561d2基因以及cyb561d2蛋白的负向调控作用,我们通过转染化学合成的miR-155mimic及可以抑制内源性miR-155表达的miR-155inhibitor,引起斑马鱼胚胎细胞ZF4内miR-155的异位表达,发现转染miR-155mimic的实验组,cyb561d2mRNA的表达水平仅为阴性对照组的0.29,其蛋白表达水平为阴性对照组的0.61,均显著下调;而转染miR-155inhibotor的实验组,其cyb561d2mRNA的表达水平则是对照组的7.71倍,其蛋白表达水平为阴性对照组的2.78倍,均显著上调。为明确斑马鱼miR-155对氟虫腈作用下ZF4细胞增殖的影响,我们使用MTT法测定了斑马鱼ZF4细胞氟虫腈暴露的IC50值为17.1mg/L,并研究了异位表达的miR-155对处于IC50氟虫腈浓度暴露下的斑马鱼细胞的增殖及存活率的影响,发现miR-155显著降低了ZF4细胞的增殖及存活率,而抑制内源miR-155的表达,则可以显著增强细胞的增殖及存活率。因此,miR-155可作为暴露于氟虫腈环境的生物标志物。考虑到miRNA与其靶基因不是一一对应的关系,我们通过生物信息学软件预测到斑马鱼cyb561d2的靶miRNA可能还包括miR-499、miR-429、miR-216b、miR-200b、miR-200c以及miR-194a。
【作者】黄涵年;
【导师】郭江峰;
【作者基本信息】浙江理工大学,生物化学与分子生物学,2014,硕士
【关键词】miR-155;cyb561d2;靶基因;细胞增殖;基因毒性;生物标志物;氟虫腈;斑马鱼;
【参考文献】
[1]陈堂敏.基于知识量的粗集理论在风机故障预测中的应用[J].制造业自动化,2005,07:11-15.
[2]奚浩瀚,刘云,熊菲.微博噪声过滤和话题检测[J].铁路计算机应用,2015,03:19-21+32.
[3]陈桥,吴祯祺,吴刚.电性能可控的聚酰亚胺/石墨烯杂化材料[A].中国化学会、中国机械工程学会、中国材料研究学会.2010年全国高分子材料科学与工程研讨会学术论文集(上册)[C].中国化学会、中国机械工程学会、中国材料研究学会:,2010:2.
[4]姚建阳.在频率域中求取薄地层的厚度[J].石油地球物理勘探,1991,05:594-599+672.
[5]刘珈含.关于中学历史课堂置入“影视中的历史”研究性教学的实践与思考[D].聊城大学,学科教学(专业学位),2014,硕士.
[6]李杰.热处理对2507不锈钢及焊接组织和性能的影响[D].西安工业大学,材料加工工程,2014,硕士.
[7]王颖.税收代位权制度研究[D].河北经贸大学,经济法,2013,硕士.
[8]王丹.中粮集团内部资本市场研究[D].内蒙古大学,会计,2013,硕士.
[9]李旭.角色扮演型网络游戏对当代青少年学生思想行为影响的研究[D].江西农业大学,思想政治教育,2012,硕士.
[10]唐琴琴.安徽汽车产业创新能力研究[D].安徽大学,产业经济学,2013,硕士.
[11]吴丹.轮毂驱动系统电磁离合器的虚拟样机设计[D].华中科技大学,电气工程,2013,硕士.
[12]韩伟.多种环境下量子纠缠的调控研究[D].曲阜师范大学,光学,2014,博士.
[13]艾显著.振荡浮子式波浪能发电设备传动系统的可靠性研究[D].上海海洋大学,机械设计及理论,2013,硕士.
[14]江竑旭.锂电池内阻动态测试系统的研究与实现[D].武汉理工大学,控制科学与工程,2013,硕士.
[15]李川.论宁浩电影的黑色幽默[D].西南大学,电影学,2013,硕士.
[16]丁月旻.黄海浒苔绿潮中生源要素的迁移转化及对生态环境的影响[D].中国科学院研究生院(海洋研究所),海洋生态学,2014,博士.
[17]高生伟.老年帕金森病患者血尿酸水平分析[D].山西医科大学,神经病学,2013,硕士.
[18]张庆楠.高管激励、董事会特征与民营上市公司绩效的关系研究[D].浙江理工大学,企业管理,2014,硕士.
[19]方彭华.侧脑室注射M617对糖尿病大鼠骨骼肌GLUT4膜转位及其信号通路的影响[D].扬州大学,生理学,2012,硕士.
[20]冯宁波.基于ARM的OTP芯片烧写测试设备的设计与实现[D].苏州大学,集成电路工程(专业学位),2013,硕士.
[21]李庆松.社会矛盾纠纷调解“公调对接”机制[D].苏州大学,法律(专业学位),2012,硕士.
[22]何屹.网上考试管理系统的设计与实现[D].电子科技大学,软件工程(专业学位),2012,硕士.
[23]和书羽.残缺美在中国景观中的塑造[D].南昌大学,设计艺术学,2012,硕士.
[24]胡吉琴.中国金融服务贸易竞争力及其影响因子分析[D].浙江工业大学,2008.
[25]董琳.一事不再理原则研究[D].吉林大学,诉讼法学,2004,硕士.
[26]李秀廷.项目过程控制研究[D].武汉理工大学,交通运输规划与管理,2003,硕士.
[27]姚从春.乙基纤维素气体复合膜的制备与改性研究[D].大连理工大学,化学工程,2013,硕士.
[28]孟兰兰.达斡尔族社会变迁与幼儿家庭教育——内蒙古莫力达瓦达斡尔族自治旗滕克乡后霍日里屯教育人类学田野调查[D].中央民族大学,教育学原理,2004,硕士.
[29]陈松.七氟醚后处理对体外循环犬肺保护作用及机制的实验研究[D].遵义医学院,麻醉学(专业学位),2014,硕士.
[30]古晓敏.工程项目物流系统物料资源优化与可靠性综合研究[D].西安建筑科技大学,物流工程,2013,硕士.
[31]杜薇.莫扎特歌剧的艺术特征探索[D].西安音乐学院,声乐教学与演唱,2014,硕士.
[32]张敏.创新学习的几个基本理论问题探微[D].安徽师范大学,教育学原理,2004,硕士.
[33]茹春云.典型阴离子在纳米铁表面的竞争吸附模型研究[D].中国地质大学(北京),环境工程,2013,硕士.
[34]陈伟健.正交异性板公路钢桥疲劳荷载研究[D].西南交通大学,桥梁与隧道工程,2013,硕士.
[35]叶雪莲.初三学生英语分层次作业设计研究[D].杭州师范大学,学科教学(专业学位),2012,硕士.
[36]翟雨佳.基于质点运动方程的气泡生长数值模拟方法研究[D].北京交通大学,2014.
[37]潘振.钢筋混凝土简支梁试验系统的研制开发[D].南京林业大学,森林工程,2004,硕士.
[38]杨文波.江西上饶铁路话调查研究[D].复旦大学,语言学及应用语言学,2013,博士.
[39]韩亚君.交互式电子白板在高中物理教学中的应用研究[D].内蒙古师范大学,学科教学(专业学位),2012,硕士.
[40]张芳芳.嘉禾县城乡一体化的评价及对策研究[D].中南林业科技大学,农村与区域发展,2014,硕士.
[41]宋丽.内观式报道的理念与实践研究[D].苏州大学,新闻与传播(专业学位),2014,硕士.
[42]罗军,宋仙林.MIS系统中信息群的发掘与实现[J].计算机工程与应用,2005,12:177-179.
[43]白日午,刘建广.速度控温的焊管温度控制系统[J].冶金自动化,2001,05:47-50.
[44]赵婷婷.左联期刊与左翼文学创作[D].南京师范大学,中国现当代文学,2011,硕士.
[45]朱艳敏.中国进出口商品的弹性分析及其对贸易收支的影响:1990—2001[D].苏州大学,金融学,2003,硕士.
[46]程美霞.促进蔚县文化旅游发展建议[D].河北大学,公共管理,2014,硕士.
[47]翁天杭.燃料乙醇产业竞争力的国际比较及发展前景预测[D].浙江大学,2013.
[48]盛媛.基因缺失天坛株痘苗病毒弱毒载体的构建及鉴定[D].吉林农业大学,预防兽医学,2014,硕士.
[49]徐高,龚庆武,李勋,张英杰.一种利用行波自然频率的杆塔故障定位新方法[J].电力系统自动化,2014,05:78-82+102.
[50]佘洁卿.基于LCA的夏热冬暖地区公共建筑碳排放及减排策略研究[D].华侨大学,管理科学与工程,2014,硕士.
- 下一篇: 时变信道下的时反OFDM水声语音通信技术研究
- 上一篇: 基于流—固耦合的汽车减振器仿真研究