大鼠肝再生过程中质膜微区比较蛋白质组研究
【摘要】肝脏是具有极强再生能力的器官,研究并阐明再生的机制可为肝移植与肝损伤相关的疾病治疗提供理论依据。质膜含有被命名为“脂筏(lipidrafts)”和“质膜微囊(Caveolae)”的微区,具有参与胞吞胞饮、信号转导、运输胆固醇等重要功能。该再生过程中,质膜微区脂筏蛋白质受到内部调控的影响会发生改变,捕获脂筏微区信号蛋白质分布的变化对于理解和阐明肝再生过程中信号通路途径等有着重要意义。本研究应用成熟的大鼠2/3肝切除模型结合蔗糖密度梯度离心法,提取假手术组(再生0h)与肝再生组(再生48h)大鼠肝脏细胞质膜,并进一步纯化获得质膜微区蛋白质。通过SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离以及ESI-Q-TOF质谱鉴定,对获得的微区蛋白质进行差异分析,结果显示,有40个微区蛋白质差异表达,其中17个蛋白质表达量上调,23个蛋白质表达量下调。生物信息学分析表明,所鉴定到的蛋白质主要参与细胞增殖、程序性死亡、细胞凋亡等调控,同时涉及到了与肝再生密切相关的血管生成等信号通路。脂筏标记蛋白1(Flotillin-1)是一个已知的脂筏微区特异性蛋白质,可作为生物标志物对复杂样本进行验证。本文通过选择Flotillin-1蛋白中两段特异性氨基酸序列合成标准肽段,并对其进行18O标记,验证质膜微区蛋白质肝再生48h组相应蛋白。该方法利用合成的标准肽段序列明确的特点,结合MRM技术(质谱多反应监测技术)对质谱结果进行分析。二级质谱图解析后的结果表明合成肽段序列能正常碎裂和鉴定。经18O标记后的合成肽段与复杂样本(质膜微区蛋白质48h组)混合,得到相差4Da质谱峰,从而可以验证复杂样本中的Flotillin-1蛋白。本研究为微区蛋白质的研究提供了方法上的参考以及相关基础数据,基于质谱技术对目标蛋白的验证为蛋白质验证方法提供了新思路,并为后续建立蛋白质绝对定量模型提供线索。
【作者】蔡乃旋;
【导师】陈平;
【作者基本信息】湖南师范大学,生物化学与分子生物学,2014,硕士
【关键词】肝再生;质膜微区;LC-MS/MS质谱;MRM;蛋白质组;
【参考文献】
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