人类DNA序列8-mer模体进化差异及酵母核小体结合序列特征分析 01月06日
【摘要】本文从8-mer模体和二阶信息冗余出发,分析人类DNA8-mer序列片段的进化分离与功能、酵母核小体中心序列与连接序列的功能差异、酵母核小体中心序列的局域特征和核小体序列与组蛋白的相互作用。整个研究分为4部分,具体内容如下。1.以人类1号染色体DNA序列为样本,将其分成CDS、5’UTR、3’UTR、内含子和基因间5类序列,分别计算它们的8-mer相对模体频数随频数的分布。发现CDS呈现单 […]
核小体定位的序列特征参数构建及人类基因转录起始区域核小体分布的统计分析 12月04日
【摘要】在生物体基因调控的复杂模式中,将遗传信息DNA转换成构成细胞的基本物质蛋白质的第一步就是转录起始。研究证实这些转录起始位点通常是缺乏核小体的区域,即核小体缺失区域,特殊的核小体包括+1核小体和-1核小体分布在它的两侧。这些特殊的区域为转录提供了可接近的位点,对基因的表达调控起到关键的作用。实验已经证实,多数招募转录因子的区域都是避免核小体的,表明转录起始位点附近核小体定位是转录因子结合难易 […]