【摘要】我们对系统比较的方法学原理做了深入的思考,揭示出上下文-对象表示法是一种便于比较的形式。同时指出,两可类比系统之间的差异程度与比较的次序无关,这一原理在比较基因组学中甚为有用,它表明同源位点的比对顺序信息对两基因组之间的p-距离计算以及其他基于p-距离的进化距离计算是无用的,因此原则上用距离法构建系统发生树无需完整的序列,也无需序列比对。我们提出了生物序列的上下文-对象表示法及其一般化形式 […]