【摘要】蛋白质是生命活动的主要承担者，结构的多样性决定了其功能的多样性。精确地预测蛋白质的空间结构对生物制药和疾病研究都有重要的意义。利用计算机手段预测蛋白质的空间结构，关键在于采样方法的效果和能量函数的准确性。能量函数主要用于对构象进行评判，但由于蛋白质进化过程的多样性和复杂性，很难设计出一种完全精确的能量函数。因而能量函数的研究一直是计算生物学中的一个难点。本文首先基于统计信息的基础上设计了一 […]

【摘要】蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题，其中一项重要的研究内容是蛋白质分子对接。由于实验测定蛋白质对接复合物结构比较困难，因此，通过计算机模拟预测分子间结合模式的对接算法受到极大关注。迄今为止已有比较成功的蛋白质对接预测算法如ZDOCK、AutoDOCK与Rosetta计算平台等。在很多蛋白质-蛋白质对接方法中，几何匹配是最为重要的打分方式，因此如果能够改进目前的几何 […]