【摘要】微生物群落样本的比较,即Beta多样性,是生态学研究中的重点研究问题。新一代测序技术使得直接从许多微生物群落中测取大量的宏基因组和宏转录组的短读段序列成为了可能。因为微生物群落中基因组的数量和序列通常是未知的,且基因组的测序覆盖率较低,要对短读段从头组装则很有挑战性,也因此传统的基于配准的序列比对方法并不适用于微生物群落的比较中。另一方面,基于k-tuple频度的非配准方法在宏基因组样本的 […]